原因分析:

1. .git目录丢失
2. 文件权限变更

.git 目录丢失

拷贝原.git目录即可

文件权限变更

常见于非Windows操作系统，长发生在跨设备移动/复制，重装操作系统等，导致文件属性、权限变更。

解决办法，进入代码项目目录执行命令：

git config core.filemode false

批量操作目录下所有项目：

for dir in `ls`; do
    echo $dir;
    cd $dir;
    git config core.filemode false
    cd ..
done

全局设定，避免以后移动文件检测到变更：

git config --global core.filemode false